Le respect des us et coutumes
Les Afars sont des nomades pasteurs qui parcourent le désert avec leurs troupeaux de moutons et de chameaux. Leur structure sociale est très hiérarchisée. Les Afars sont polygames, mais les femmes ne sont pas voilées. Les Issas sont aussi des nomades qui se déplacent librement entre Djibouti et la Somalie. Afars et Issas, ennemis de longue date, étaient connus pour leurs mœurs guerrières. Les disputes pour la possession du bétail, des pâturages et des points d’eau, dégénéraient souvent en conflits sanglants. Aujourd’hui, les affrontements sont rares, mais le nomade ne se sépare jamais de son poignard et de son arme à feu. Le soir venu, les familles se rassemblent dans des campements de huttes rondes appelées toukouls.
En ville, dès le début de l’après-midi, les hommes se réunissent dans les maisons où, allongés sur des tapis et coussins, ils mâchent des heures entières du qat, une plante euphorisante qui constitue un véritable fléau social. La circoncision et l’excision sont des usages généraux ; nul n’y échappe. La coutume de se faire tailler les dents, chez les hommes, est assez répandue.

Voici quelques conseils pour respecter ces populations locales, leurs traditions et religions.
Même si la population est relativement tolérante, il convient d’observer, comme dans tous pays musulmans, une certaine correction dans la tenue comme dans le comportement. 
— Portez une tenue vestimentaire adaptée, longue et ample, recouvrant les jambes et les épaules, pour les femmes comme pour les hommes.
— En couple, soyez discrets dans vos signes d’affection.  
— Dans les cases, ne marchez jamais sur une natte avec vos chaussures.
— Ne distribuez jamais de bonbons, stylos ou autres cadeaux, en particulier aux enfants, car ce comportement les incite à la mendicité, à abandonner l’école ou leur activité habituelle. Si vous souhaitez faire un don, il est préférable et plus utile de le faire auprès d’une organisation locale : association, école, dispensaire. Demandez à votre guide, qui vous indiquera le lieu le plus approprié.

La préservation de l’environnement
— La faune
• La faune sous-marine est extraordinaire : thons, barracudas, mérous, murènes, loches, raies manta... sans parler des milliers de poissons de coraux (poisson clowns, balistes, perroquets verts). La chasse sous-marine est interdite, la pêche est réglementée, la capture des tortues et de leurs œufs ainsi que la collecte des coquillages et des coraux sont interdites.
• La faune terrestre est riche : vautours, aigles de mer, hérons, ibis,  pélicans, flamants roses, outardes communes, autruches devenues rares, antilopes, gazelles, antilopes naines... On peut aussi rencontrer le fennec, le chacal, le chat sauvage, la hyène, le guépard, la panthère. Il faut encore citer le phacochère, les singes divers, les varans (lézards géants), les écureuils de sable...
— La flore
Le Day et le massif des Mablas abritent les deux seules forêts du pays (ficus, genévriers, dragonniers...). Plusieurs régions sont particulièrement arides et dénudées : les alentours du lac salé Assal, la plaine argileuse du Grand Bara, et de très nombreux plateaux rocailleux. Au sud du Grand Bara, des graminées forment quelques prairies qui deviennent un excellent pâturage à l’époque des pluies. Les zones les plus favorisées sont les rives des oueds tapissées d’épineux, d’acacias, de tamaris et de jujubiers. Sur certaines parties du littoral et sur certaines îles, poussent des palétuviers.